Um estudo recém-publicado na Revista Nature Communications apresenta um método inovador para a montagem de genomas, que é o conjunto de informações hereditárias presentes no DNA ou, em alguns vírus, no RNA. A pesquisa intitulada Sequenciamento direcionado e montagem iterativa de genomas quase completos foi desenvolvida por uma colaboração internacional que inclui os professores Renata Coelho Rodrigues Noronha e Luís Adriano Nascimento, da Universidade Federal do Pará (UFPA).
Batizada de Cornetto, a nova técnica combina sequenciamento direcionado e procedimentos iterativos de reconstrução para gerar genomas praticamente completos com maior eficiência. Diferentemente dos métodos tradicionais, que produzem grandes volumes de dados sem distinção, o Cornetto utiliza o sequenciamento por nanoporo, uma tecnologia que lê moléculas de DNA ao fazê-las passar por poros minúsculos e medir variações de corrente elétrica, de forma seletiva, focando nas regiões genômicas que permanecem incompletas após a primeira montagem.
A abordagem consiste em identificar trechos problemáticos, muitas vezes regiões repetitivas ou de difícil leitura, e direcionar novos ciclos de sequenciamento especificamente para essas áreas. Esse processo é repetido até que o genoma apresente alta completude, reduzindo custos e aumentando significativamente a qualidade do resultado final.
De acordo com o estudo, a técnica mostrou-se eficaz na diminuição de lacunas comuns nas metodologias convencionais. “Trata-se do desenvolvimento mais rápido e eficiente de análise, que ajuda a entender melhor como as atividades desenvolvidas pelo homem podem influenciar o meio ambiente e as características dos seres vivos aqui da Amazônia, como os peixes”, explica o professor Luís Adriano.
A professora Renata Noronha destaca a relevância do avanço: “O desenvolvimento e a implementação do Cornetto ampliam significativamente as capacidades da pesquisa genômica na Amazônia, fornecendo uma ferramenta poderosa para o monitoramento e a proteção do ecossistema local com maior precisão e eficiência. Essa integração entre tecnologia de ponta, biodiversidade regional e cooperação internacional abre novos caminhos promissores para a conservação ambiental e para a compreensão dos efeitos das atividades humanas no bioma amazônico”, afirma.
Aplicações na Amazônia – Uma das aplicações mais promissoras do Cornetto foi seu uso no sequenciamento do genoma de um peixe nativo da Amazônia. Com a técnica, foi possível obter, pela primeira vez, o genoma de alta cobertura de Geophagus surinamensis, um ciclídeo típico da região.
Segundo a professora Renata Noronha, a espécie foi selecionada por estar sujeita a impactos ambientais significativos, o que a torna um organismo modelo relevante para estudos ecológicos e genéticos. “Com esse sequenciamento detalhado, será possível analisar genes associados à resposta a diferentes tipos de poluição. Assim, os resultados abrem caminho para monitorar os efeitos das alterações ambientais e compreender como esses peixes se adaptam — ou são afetados — pelas mudanças provocadas por atividades humanas”, destaca.
Confira a pesquisa completa aqui.
